牙膏备案和化妆品备案不是同一套制度。牙膏适用《牙膏监督管理办法》及相关配套文件，由备案人在上市前通过规定的信息服务平台提交备案资料；化妆品则适用《化妆品监督管理条例》及《化妆品注册备案管理办法》，并区分为普通化妆品备案和特殊化妆品注册。牙膏没有“普通备案 / 特殊注册”这种二分法，功效宣称评价也主要依据牙膏专门规范，而不是直接套用《化妆品功效宣称评价规范》。
管理依据不同
《牙膏监督管理办法》将牙膏作为独立品类管理。备案人应对牙膏的质量安全和功效宣称负责，提交的资料应能反映配方、执行标准、标签、检验和安全评估等情况。牙膏也实行年度报告制度，备案时间满一年的产品，一般应在每年1月1日至3月31日提交年度报告。具体填报以平台当时要求为准。
功效评价要求不同
牙膏的清洁功效，通常不需要额外开展功效评价。宣称防龋、抑牙菌斑、抗牙本质敏感、减轻牙龈问题等情形，一般应开展人体功效评价并提交相应资料；含氟牙膏在氟含量符合规定时，防龋宣称可以按规定免于评价。美白（去渍美白）、抗牙石、减轻口臭等清洁以外的功效，也要按牙膏功效评价要求提供依据。详见牙膏功效宣称（防龋、美白、抗敏等）如何评价？。
编号和查询也不通用
化妆品备案编号、特殊化妆品注册证编号与牙膏备案编号规则不同，不能互相套用。查询应使用国家药监局官方平台，结果以官方显示为准，见化妆品备案或注册信息在哪里查？。如果我们协助办理牙膏备案，会按牙膏的资料和评价要求准备，而不是把化妆品备案模板直接改个名字使用。